Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAF7Q6Q0C0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAF7Q6Q0C0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAF7Q6Q0C0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAF7Q6Q0C0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAF7Q6Q0C0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAF7Q6Q0C0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAF7Q6Q0C0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAF7Q6Q0C0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAF7Q6Q0C0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF7Q6Q0C0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAF7Q6Q0C0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAF7Q6Q0C0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAF7Q6Q0C0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF7Q6Q0C0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF7Q6Q0C0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF7Q6Q0C0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAF7Q6Q0C0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAF7Q6Q0C0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAF7Q6Q0C0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms