Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI98

INO80C, INO80 complex subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80CQ6PI98 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INO80CQ6PI98 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80CQ6PI98 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80CQ6PI98 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80CQ6PI98 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80CQ6PI98 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms