Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLC3Q6P597 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KLC3Q6P597 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLC3Q6P597 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLC3Q6P597 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KLC3Q6P597 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KLC3Q6P597 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLC3Q6P597 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLC3Q6P597 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLC3Q6P597 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLC3Q6P597 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLC3Q6P597 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLC3Q6P597 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLC3Q6P597 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KLC3Q6P597 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms