Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHBDD2Q6NTF9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDD2Q6NTF9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDD2Q6NTF9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHBDD2Q6NTF9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDD2Q6NTF9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDD2Q6NTF9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDD2Q6NTF9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDD2Q6NTF9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDD2Q6NTF9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms