Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMBOX1Q6NT76 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMBOX1Q6NT76 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMBOX1Q6NT76 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMBOX1Q6NT76 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMBOX1Q6NT76 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMBOX1Q6NT76 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.1 ms