Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM68Q6AZZ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM68Q6AZZ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM68Q6AZZ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms