Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP135Q66GS9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP135Q66GS9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP135Q66GS9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP135Q66GS9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP135Q66GS9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms