Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM27BQ5VT28 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27BQ5VT28 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM27BQ5VT28 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM27BQ5VT28 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM27BQ5VT28 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms