Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GKAP1Q5VSY0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GKAP1Q5VSY0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GKAP1Q5VSY0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GKAP1Q5VSY0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms