Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPO2Q5TGU0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPO2Q5TGU0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPO2Q5TGU0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms