Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCQ9

MAGI3, Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGI3Q5TCQ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
MAGI3Q5TCQ9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
MAGI3Q5TCQ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
MAGI3Q5TCQ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
MAGI3Q5TCQ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
MAGI3Q5TCQ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
MAGI3Q5TCQ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
MAGI3Q5TCQ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
MAGI3Q5TCQ9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
MAGI3Q5TCQ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
MAGI3Q5TCQ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
MAGI3Q5TCQ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
MAGI3Q5TCQ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
MAGI3Q5TCQ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
MAGI3Q5TCQ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
MAGI3Q5TCQ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
MAGI3Q5TCQ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
MAGI3Q5TCQ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
MAGI3Q5TCQ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
MAGI3Q5TCQ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
MAGI3Q5TCQ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
MAGI3Q5TCQ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
MAGI3Q5TCQ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
MAGI3Q5TCQ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
MAGI3Q5TCQ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
MAGI3Q5TCQ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
MAGI3Q5TCQ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
MAGI3Q5TCQ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41.02■■■■■ 4.16
MAGI3Q5TCQ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
MAGI3Q5TCQ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
MAGI3Q5TCQ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
MAGI3Q5TCQ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
MAGI3Q5TCQ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
MAGI3Q5TCQ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
MAGI3Q5TCQ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
MAGI3Q5TCQ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
MAGI3Q5TCQ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
MAGI3Q5TCQ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
MAGI3Q5TCQ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
MAGI3Q5TCQ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
MAGI3Q5TCQ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
MAGI3Q5TCQ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
MAGI3Q5TCQ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
MAGI3Q5TCQ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
MAGI3Q5TCQ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
MAGI3Q5TCQ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
MAGI3Q5TCQ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
MAGI3Q5TCQ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
MAGI3Q5TCQ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
MAGI3Q5TCQ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
MAGI3Q5TCQ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
MAGI3Q5TCQ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
MAGI3Q5TCQ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
MAGI3Q5TCQ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
MAGI3Q5TCQ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
MAGI3Q5TCQ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms