Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB41Q5JT25 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB41Q5JT25 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB41Q5JT25 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB41Q5JT25 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB41Q5JT25 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB41Q5JT25 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB41Q5JT25 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB41Q5JT25 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB41Q5JT25 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB41Q5JT25 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB41Q5JT25 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB41Q5JT25 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB41Q5JT25 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB41Q5JT25 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB41Q5JT25 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms