Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD3Q5JSP0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGD3Q5JSP0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD3Q5JSP0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD3Q5JSP0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms