Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NHLRC3Q5JS37 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLRC3Q5JS37 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLRC3Q5JS37 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NHLRC3Q5JS37 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms