Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R8

SLC22A6, Solute carrier family 22 member 6, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A6Q4U2R8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A6Q4U2R8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A6Q4U2R8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A6Q4U2R8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A6Q4U2R8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A6Q4U2R8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms