Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UVSSAQ2YD98 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
UVSSAQ2YD98 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UVSSAQ2YD98 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UVSSAQ2YD98 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
UVSSAQ2YD98 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UVSSAQ2YD98 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UVSSAQ2YD98 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UVSSAQ2YD98 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UVSSAQ2YD98 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UVSSAQ2YD98 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UVSSAQ2YD98 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UVSSAQ2YD98 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UVSSAQ2YD98 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UVSSAQ2YD98 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UVSSAQ2YD98 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms