Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMN1Q16637 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMN1Q16637 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMN1Q16637 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMN1Q16637 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMN1Q16637 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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