Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GRIK5Q16478 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GRIK5Q16478 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIK5Q16478 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
GRIK5Q16478 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GRIK5Q16478 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIK5Q16478 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIK5Q16478 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GRIK5Q16478 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIK5Q16478 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GRIK5Q16478 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIK5Q16478 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GRIK5Q16478 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIK5Q16478 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIK5Q16478 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIK5Q16478 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIK5Q16478 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GRIK5Q16478 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GRIK5Q16478 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GRIK5Q16478 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIK5Q16478 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIK5Q16478 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GRIK5Q16478 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GRIK5Q16478 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIK5Q16478 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIK5Q16478 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIK5Q16478 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRIK5Q16478 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GRIK5Q16478 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIK5Q16478 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIK5Q16478 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIK5Q16478 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIK5Q16478 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIK5Q16478 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIK5Q16478 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
GRIK5Q16478 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GRIK5Q16478 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
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