Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXT1Q16394 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXT1Q16394 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXT1Q16394 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXT1Q16394 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXT1Q16394 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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