Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX1Q16384 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX1Q16384 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX1Q16384 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSX1Q16384 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX1Q16384 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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