Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ALX1Q15699 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ALX1Q15699 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
ALX1Q15699 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ALX1Q15699 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ALX1Q15699 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ALX1Q15699 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
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