Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEC23AQ15436 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEC23AQ15436 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEC23AQ15436 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEC23AQ15436 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEC23AQ15436 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEC23AQ15436 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC23AQ15436 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC23AQ15436 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC23AQ15436 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC23AQ15436 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEC23AQ15436 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SEC23AQ15436 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SEC23AQ15436 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEC23AQ15436 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SEC23AQ15436 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SEC23AQ15436 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
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