Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERBB4Q15303 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERBB4Q15303 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERBB4Q15303 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERBB4Q15303 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ERBB4Q15303 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERBB4Q15303 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
ERBB4Q15303 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERBB4Q15303 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERBB4Q15303 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERBB4Q15303 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERBB4Q15303 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERBB4Q15303 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERBB4Q15303 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ERBB4Q15303 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ERBB4Q15303 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERBB4Q15303 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERBB4Q15303 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERBB4Q15303 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERBB4Q15303 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERBB4Q15303 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERBB4Q15303 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
ERBB4Q15303 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERBB4Q15303 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERBB4Q15303 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERBB4Q15303 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERBB4Q15303 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERBB4Q15303 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERBB4Q15303 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERBB4Q15303 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERBB4Q15303 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERBB4Q15303 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERBB4Q15303 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERBB4Q15303 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERBB4Q15303 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERBB4Q15303 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERBB4Q15303 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERBB4Q15303 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms