Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
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