Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERPUD1Q15011 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD1Q15011 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD1Q15011 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD1Q15011 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD1Q15011 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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