Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMB3Q13751 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMB3Q13751 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB3Q13751 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMB3Q13751 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMB3Q13751 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMB3Q13751 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms