Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P11Q13670 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PMS2P11Q13670 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PMS2P11Q13670 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMS2P11Q13670 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P11Q13670 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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