Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PAPPAQ13219 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PAPPAQ13219 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PAPPAQ13219 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PAPPAQ13219 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PAPPAQ13219 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PAPPAQ13219 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PAPPAQ13219 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PAPPAQ13219 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PAPPAQ13219 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PAPPAQ13219 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PAPPAQ13219 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PAPPAQ13219 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PAPPAQ13219 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PAPPAQ13219 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PAPPAQ13219 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PAPPAQ13219 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PAPPAQ13219 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PAPPAQ13219 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PAPPAQ13219 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PAPPAQ13219 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PAPPAQ13219 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PAPPAQ13219 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PAPPAQ13219 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PAPPAQ13219 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PAPPAQ13219 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PAPPAQ13219 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PAPPAQ13219 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PAPPAQ13219 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PAPPAQ13219 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PAPPAQ13219 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PAPPAQ13219 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PAPPAQ13219 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PAPPAQ13219 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PAPPAQ13219 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PAPPAQ13219 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PAPPAQ13219 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PAPPAQ13219 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PAPPAQ13219 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PAPPAQ13219 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
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