Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERCC8Q13216 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERCC8Q13216 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERCC8Q13216 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERCC8Q13216 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms