Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CALCOCO2Q13137 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCOCO2Q13137 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALCOCO2Q13137 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CALCOCO2Q13137 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCOCO2Q13137 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
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