Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
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