Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TP53BP1Q12888 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TP53BP1Q12888 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TP53BP1Q12888 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TP53BP1Q12888 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TP53BP1Q12888 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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