Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASGEF1BQ0VAM2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASGEF1BQ0VAM2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASGEF1BQ0VAM2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGEF1BQ0VAM2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms