Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFFO1Q0D2I5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFFO1Q0D2I5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFFO1Q0D2I5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFFO1Q0D2I5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms