Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPIRE1Q08AE8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPIRE1Q08AE8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SPIRE1Q08AE8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPIRE1Q08AE8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPIRE1Q08AE8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPIRE1Q08AE8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPIRE1Q08AE8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPIRE1Q08AE8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPIRE1Q08AE8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPIRE1Q08AE8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPIRE1Q08AE8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPIRE1Q08AE8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPIRE1Q08AE8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPIRE1Q08AE8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPIRE1Q08AE8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPIRE1Q08AE8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms