Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAV1Q03135 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAV1Q03135 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAV1Q03135 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAV1Q03135 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms