Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC44.4■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
TOP2BQ02880 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
TOP2BQ02880 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
TOP2BQ02880 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
TOP2BQ02880 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
TOP2BQ02880 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
TOP2BQ02880 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
TOP2BQ02880 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
TOP2BQ02880 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC44.25■■■■■ 4.67
TOP2BQ02880 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TOP2BQ02880 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TOP2BQ02880 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
TOP2BQ02880 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
TOP2BQ02880 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.19■■■■■ 4.66
TOP2BQ02880 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
TOP2BQ02880 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC44.18■■■■■ 4.66
TOP2BQ02880 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
TOP2BQ02880 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
TOP2BQ02880 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
TOP2BQ02880 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
TOP2BQ02880 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
TOP2BQ02880 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
TOP2BQ02880 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.66
TOP2BQ02880 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.65
TOP2BQ02880 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
TOP2BQ02880 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
TOP2BQ02880 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
TOP2BQ02880 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
TOP2BQ02880 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
TOP2BQ02880 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
TOP2BQ02880 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.07■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
TOP2BQ02880 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
TOP2BQ02880 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
TOP2BQ02880 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
TOP2BQ02880 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
TOP2BQ02880 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
TOP2BQ02880 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
TOP2BQ02880 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
TOP2BQ02880 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
TOP2BQ02880 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
TOP2BQ02880 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
TOP2BQ02880 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
TOP2BQ02880 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
TOP2BQ02880 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
TOP2BQ02880 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
TOP2BQ02880 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
TOP2BQ02880 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms