Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HBG1P69891 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HBG1P69891 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HBG1P69891 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HBG1P69891 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HBG1P69891 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HBG1P69891 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HBG1P69891 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HBG1P69891 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HBG1P69891 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HBG1P69891 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HBG1P69891 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HBG1P69891 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HBG1P69891 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HBG1P69891 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HBG1P69891 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HBG1P69891 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HBG1P69891 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HBG1P69891 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HBG1P69891 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HBG1P69891 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HBG1P69891 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HBG1P69891 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HBG1P69891 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HBG1P69891 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HBG1P69891 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HBG1P69891 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HBG1P69891 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HBG1P69891 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HBG1P69891 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HBG1P69891 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HBG1P69891 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HBG1P69891 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HBG1P69891 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HBG1P69891 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HBG1P69891 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HBG1P69891 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HBG1P69891 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HBG1P69891 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HBG1P69891 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HBG1P69891 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HBG1P69891 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HBG1P69891 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HBG1P69891 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HBG1P69891 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HBG1P69891 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HBG1P69891 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HBG1P69891 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HBG1P69891 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HBG1P69891 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HBG1P69891 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HBG1P69891 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HBG1P69891 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HBG1P69891 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HBG1P69891 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HBG1P69891 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HBG1P69891 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HBG1P69891 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HBG1P69891 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HBG1P69891 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HBG1P69891 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HBG1P69891 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HBG1P69891 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HBG1P69891 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HBG1P69891 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HBG1P69891 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HBG1P69891 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HBG1P69891 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HBG1P69891 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HBG1P69891 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HBG1P69891 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HBG1P69891 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HBG1P69891 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HBG1P69891 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HBG1P69891 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HBG1P69891 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HBG1P69891 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HBG1P69891 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HBG1P69891 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HBG1P69891 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HBG1P69891 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HBG1P69891 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HBG1P69891 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HBG1P69891 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HBG1P69891 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HBG1P69891 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HBG1P69891 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HBG1P69891 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HBG1P69891 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HBG1P69891 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HBG1P69891 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HBG1P69891 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HBG1P69891 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HBG1P69891 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HBG1P69891 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HBG1P69891 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HBG1P69891 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HBG1P69891 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HBG1P69891 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HBG1P69891 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms