Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX1BP61266 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STX1BP61266 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
STX1BP61266 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX1BP61266 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX1BP61266 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX1BP61266 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX1BP61266 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX1BP61266 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX1BP61266 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX1BP61266 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX1BP61266 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1BP61266 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1BP61266 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX1BP61266 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX1BP61266 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX1BP61266 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX1BP61266 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX1BP61266 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX1BP61266 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX1BP61266 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1BP61266 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1BP61266 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1BP61266 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1BP61266 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1BP61266 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX1BP61266 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX1BP61266 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX1BP61266 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX1BP61266 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX1BP61266 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX1BP61266 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX1BP61266 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX1BP61266 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX1BP61266 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX1BP61266 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1BP61266 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1BP61266 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1BP61266 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1BP61266 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1BP61266 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1BP61266 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1BP61266 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1BP61266 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1BP61266 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1BP61266 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1BP61266 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1BP61266 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1BP61266 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1BP61266 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1BP61266 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1BP61266 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1BP61266 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX1BP61266 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX1BP61266 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX1BP61266 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX1BP61266 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX1BP61266 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX1BP61266 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX1BP61266 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX1BP61266 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX1BP61266 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX1BP61266 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1BP61266 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1BP61266 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX1BP61266 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1BP61266 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1BP61266 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1BP61266 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX1BP61266 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1BP61266 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1BP61266 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX1BP61266 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX1BP61266 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX1BP61266 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX1BP61266 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX1BP61266 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX1BP61266 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1BP61266 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1BP61266 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1BP61266 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX1BP61266 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1BP61266 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1BP61266 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1BP61266 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1BP61266 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1BP61266 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX1BP61266 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1BP61266 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1BP61266 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1BP61266 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1BP61266 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1BP61266 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX1BP61266 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1BP61266 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1BP61266 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1BP61266 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1BP61266 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1BP61266 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX1BP61266 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms