Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3S2P59780 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3S2P59780 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3S2P59780 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms