Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FXYD4P59646 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FXYD4P59646 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FXYD4P59646 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FXYD4P59646 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FXYD4P59646 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FXYD4P59646 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FXYD4P59646 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FXYD4P59646 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms