Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00310P59036 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00310P59036 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00310P59036 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00310P59036 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00310P59036 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00310P59036 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms