Protein–RNA interactions for Protein: P56703

WNT3, Proto-oncogene Wnt-3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3P56703 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WNT3P56703 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WNT3P56703 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WNT3P56703 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WNT3P56703 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WNT3P56703 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WNT3P56703 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WNT3P56703 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WNT3P56703 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WNT3P56703 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WNT3P56703 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WNT3P56703 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WNT3P56703 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WNT3P56703 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WNT3P56703 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WNT3P56703 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
WNT3P56703 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WNT3P56703 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WNT3P56703 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WNT3P56703 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WNT3P56703 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WNT3P56703 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WNT3P56703 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WNT3P56703 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
WNT3P56703 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT3P56703 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT3P56703 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT3P56703 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT3P56703 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT3P56703 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT3P56703 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT3P56703 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT3P56703 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT3P56703 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT3P56703 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT3P56703 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT3P56703 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT3P56703 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT3P56703 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT3P56703 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT3P56703 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT3P56703 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT3P56703 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT3P56703 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WNT3P56703 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WNT3P56703 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WNT3P56703 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
WNT3P56703 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT3P56703 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT3P56703 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT3P56703 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT3P56703 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT3P56703 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT3P56703 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT3P56703 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT3P56703 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT3P56703 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
WNT3P56703 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WNT3P56703 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WNT3P56703 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WNT3P56703 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WNT3P56703 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT3P56703 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT3P56703 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT3P56703 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT3P56703 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT3P56703 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
WNT3P56703 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WNT3P56703 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WNT3P56703 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WNT3P56703 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT3P56703 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT3P56703 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT3P56703 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT3P56703 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT3P56703 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT3P56703 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT3P56703 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT3P56703 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WNT3P56703 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
WNT3P56703 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WNT3P56703 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WNT3P56703 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WNT3P56703 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WNT3P56703 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WNT3P56703 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WNT3P56703 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WNT3P56703 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT3P56703 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT3P56703 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT3P56703 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT3P56703 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT3P56703 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT3P56703 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT3P56703 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT3P56703 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT3P56703 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT3P56703 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT3P56703 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT3P56703 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms