Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHA4P54764 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHA4P54764 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHA4P54764 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHA4P54764 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHA4P54764 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHA4P54764 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHA4P54764 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHA4P54764 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHA4P54764 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPHA4P54764 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHA4P54764 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms