Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATXN1P54253 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN1P54253 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATXN1P54253 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN1P54253 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATXN1P54253 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms