Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA8P53708 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGA8P53708 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA8P53708 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA8P53708 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA8P53708 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms