Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NUP153P49790 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
NUP153P49790 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NUP153P49790 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
NUP153P49790 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
NUP153P49790 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
NUP153P49790 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
NUP153P49790 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
NUP153P49790 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
NUP153P49790 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NUP153P49790 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NUP153P49790 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NUP153P49790 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
NUP153P49790 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
NUP153P49790 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
NUP153P49790 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
NUP153P49790 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
NUP153P49790 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
NUP153P49790 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NUP153P49790 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
NUP153P49790 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
NUP153P49790 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.28■■■■■ 4.2
NUP153P49790 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
NUP153P49790 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
NUP153P49790 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
NUP153P49790 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
NUP153P49790 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NUP153P49790 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
NUP153P49790 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
NUP153P49790 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
NUP153P49790 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
NUP153P49790 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
NUP153P49790 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
NUP153P49790 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
NUP153P49790 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
NUP153P49790 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
NUP153P49790 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
NUP153P49790 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
NUP153P49790 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
NUP153P49790 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NUP153P49790 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NUP153P49790 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
NUP153P49790 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
NUP153P49790 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NUP153P49790 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NUP153P49790 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
NUP153P49790 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NUP153P49790 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NUP153P49790 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NUP153P49790 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
NUP153P49790 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NUP153P49790 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NUP153P49790 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NUP153P49790 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NUP153P49790 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
NUP153P49790 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
NUP153P49790 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
NUP153P49790 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
NUP153P49790 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
NUP153P49790 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
NUP153P49790 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
NUP153P49790 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NUP153P49790 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NUP153P49790 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
NUP153P49790 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NUP153P49790 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
NUP153P49790 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
NUP153P49790 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
NUP153P49790 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NUP153P49790 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NUP153P49790 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NUP153P49790 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NUP153P49790 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NUP153P49790 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NUP153P49790 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NUP153P49790 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NUP153P49790 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
NUP153P49790 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.94■■■■■ 4.15
NUP153P49790 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
NUP153P49790 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
NUP153P49790 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
NUP153P49790 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
NUP153P49790 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
NUP153P49790 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NUP153P49790 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NUP153P49790 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NUP153P49790 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NUP153P49790 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NUP153P49790 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
NUP153P49790 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
NUP153P49790 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
NUP153P49790 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
NUP153P49790 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
NUP153P49790 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
NUP153P49790 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
NUP153P49790 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
NUP153P49790 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
NUP153P49790 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
NUP153P49790 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
NUP153P49790 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms