Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX2P48378 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX2P48378 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX2P48378 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX2P48378 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX2P48378 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX2P48378 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX2P48378 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX2P48378 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX2P48378 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX2P48378 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX2P48378 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX2P48378 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX2P48378 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX2P48378 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX2P48378 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX2P48378 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX2P48378 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX2P48378 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX2P48378 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX2P48378 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX2P48378 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX2P48378 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX2P48378 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX2P48378 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX2P48378 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX2P48378 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX2P48378 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX2P48378 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFX2P48378 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX2P48378 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX2P48378 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX2P48378 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX2P48378 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX2P48378 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX2P48378 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX2P48378 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX2P48378 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX2P48378 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX2P48378 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX2P48378 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX2P48378 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX2P48378 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX2P48378 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX2P48378 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX2P48378 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX2P48378 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX2P48378 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX2P48378 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX2P48378 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX2P48378 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX2P48378 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX2P48378 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX2P48378 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX2P48378 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX2P48378 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX2P48378 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX2P48378 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX2P48378 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX2P48378 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX2P48378 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX2P48378 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX2P48378 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX2P48378 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX2P48378 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX2P48378 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX2P48378 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX2P48378 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX2P48378 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX2P48378 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX2P48378 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX2P48378 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX2P48378 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX2P48378 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX2P48378 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX2P48378 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX2P48378 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX2P48378 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX2P48378 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX2P48378 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX2P48378 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX2P48378 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX2P48378 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX2P48378 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX2P48378 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX2P48378 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX2P48378 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX2P48378 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX2P48378 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX2P48378 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX2P48378 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX2P48378 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX2P48378 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX2P48378 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX2P48378 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX2P48378 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX2P48378 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX2P48378 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX2P48378 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX2P48378 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms