Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA2P47869 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA2P47869 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GABRA2P47869 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA2P47869 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA2P47869 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms