Protein–RNA interactions for Protein: P43308

SSR2, Translocon-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2P43308 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSR2P43308 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSR2P43308 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SSR2P43308 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSR2P43308 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSR2P43308 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSR2P43308 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSR2P43308 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSR2P43308 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSR2P43308 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSR2P43308 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSR2P43308 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSR2P43308 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSR2P43308 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSR2P43308 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSR2P43308 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSR2P43308 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSR2P43308 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSR2P43308 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR2P43308 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR2P43308 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSR2P43308 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSR2P43308 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSR2P43308 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSR2P43308 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSR2P43308 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSR2P43308 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSR2P43308 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SSR2P43308 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSR2P43308 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSR2P43308 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSR2P43308 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSR2P43308 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSR2P43308 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSR2P43308 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSR2P43308 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSR2P43308 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSR2P43308 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSR2P43308 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSR2P43308 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSR2P43308 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSR2P43308 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSR2P43308 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSR2P43308 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSR2P43308 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSR2P43308 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSR2P43308 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSR2P43308 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSR2P43308 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSR2P43308 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSR2P43308 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR2P43308 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR2P43308 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR2P43308 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR2P43308 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR2P43308 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR2P43308 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR2P43308 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR2P43308 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR2P43308 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSR2P43308 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSR2P43308 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSR2P43308 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSR2P43308 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSR2P43308 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SSR2P43308 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR2P43308 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR2P43308 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR2P43308 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR2P43308 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR2P43308 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR2P43308 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR2P43308 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR2P43308 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR2P43308 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR2P43308 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR2P43308 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR2P43308 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR2P43308 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR2P43308 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR2P43308 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR2P43308 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR2P43308 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSR2P43308 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSR2P43308 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSR2P43308 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSR2P43308 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSR2P43308 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSR2P43308 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSR2P43308 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SSR2P43308 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSR2P43308 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SSR2P43308 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSR2P43308 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSR2P43308 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSR2P43308 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR2P43308 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR2P43308 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSR2P43308 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSR2P43308 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms